Visų pirma, vienas didžiausių 3D spausdinimo trūkumų yra kaina. Pradinės investicijos į 3D spausdinimo technologiją gali būti gana didelės, ypač aukštos klasės spausdintuvams. Be to, 3D spausdinimui naudojamų medžiagų kaina taip pat gali būti brangi. Namų vartotojams tai gali paversti 3D spausdinimą pigesniu nei įperkamu hobiu.
Kitas didelis trūkumas yra 3D spausdinimo greitis. Palyginti su tradiciniais gamybos metodais, 3D spausdinimas gali būti lėtas procesas. Tai ypač pasakytina apie didesnius ir sudėtingesnius dizainus. Dėl tokio lėto spausdinimo greičio gali pailgėti pristatymo laikas ir vėluoti gamybos grafikai.
Trečias 3D spausdinimo trūkumas yra ribota medžiagų, kurias galima naudoti, įvairovė. Nors padaryta didelė pažanga medžiagų, kurias galima naudoti 3D spausdinimui, tipų srityje, turimų medžiagų asortimentas vis dar yra daug ribotesnis nei tradiciniai gamybos metodai. Tam tikroms programoms, pvz., gaminiams, kuriems reikalingas didelis stiprumas arba atsparumas temperatūrai, 3D spausdinimas gali būti ne geriausias pasirinkimas.
Apibendrinant, nors 3D spausdinimas turi daug privalumų, jis nėra be trūkumų. Kaina, greitis, ribota medžiagų įvairovė ir galimas pavojus sveikatai yra veiksniai, į kuriuos reikia atsižvelgti renkantis 3D spausdinimą kaip gamybos būdą. Įmonės ir asmenys turi pasverti 3D spausdinimo privalumus ir trūkumus, kad nustatytų, ar tai geriausias pasirinkimas jų poreikiams.
